Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YARSP54577 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YARSP54577 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YARSP54577 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YARSP54577 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YARSP54577 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YARSP54577 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YARSP54577 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YARSP54577 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YARSP54577 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms