Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms