Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRISP1P54107 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRISP1P54107 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms