Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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