Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 DPB11YJL090C 2295 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RTT107YHR154W 3213 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 VPS34YLR240W 2628 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 PTC5YOR090C 1719 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 IRC4YDR540C 540 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RNR4YGR180C 1038 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 LAG1YHL003C 1236 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 TPM2YIL138C 486 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RPL40AYIL148W 387 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YKL044WYKL044W 321 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YLR255CYLR255C 354 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 PHO80YOL001W 882 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 MET18YIL128W 3099 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 NAM7YMR080C 2916 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 MNE1YOR350C 1992 nt1.61□□□□□ -2.15
SYF2P53277 IRC10YOL015W 1761 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 SNC1YAL030W 354 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 CMS1YLR003C 876 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 AFB1YLR040C 675 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 TOA1YOR194C 861 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 TRS20YBR254C 528 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 Q0017Q0017 162 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YDR341CYDR341C 1824 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 SOK2YMR016C 2358 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RPL37BYDR500C 267 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 COX13YGL191W 390 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 TIM10YHR005C-A 282 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 IST3YIR005W 447 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RAM2YKL019W 951 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YLR458WYLR458W 381 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 URA10YMR271C 684 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 RPS7BYNL096C 573 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 ATX2YOR079C 942 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 YPL039WYPL039W 951 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF2P53277 PEX8YGR077C 1770 nt1.59□□□□□ -2.16
SYF2P53277 VPS15YBR097W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 REV1YOR346W 2958 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YDR220CYDR220C 294 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MET32YDR253C 576 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YGR290WYGR290W 444 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 LSM7YNL147W 348 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 RPB11YOL005C 363 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 IRC16YPR038W 360 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 DFG16YOR030W 1860 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF2P53277 SPR3YGR059W 1539 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MDM32YOR147W 1869 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 PAU3YCR104W 375 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 HNT1YDL125C 477 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 CTK3YML112W 891 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MRPL44YMR225C 297 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 SVS1YPL163C 783 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 SYH1YPL105C 2550 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 RNH70YGR276C 1662 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 BRO1YPL084W 2535 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 BPH1YCR032W 6504 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF2P53277 NAN1YPL126W 2691 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 CAJ1YER048C 1176 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 PRE4YFR050C 801 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 RPL9AYGL147C 576 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 RPA34YJL148W 702 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 TIM8YJR135W-A 264 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YLR031WYLR031W 561 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YLR053CYLR053C 327 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MGR1YCL044C 1254 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 UTP13YLR222C 2454 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF2P53277 CFT2YLR115W 2580 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 STB4YMR019W 2850 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 EAF6YJR082C 342 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 TEN1YLR010C 483 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YOR105WYOR105W 327 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YPL197CYPL197C 414 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 BUD2YKL092C 3315 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 CDC53YDL132W 2448 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF2P53277 BFA1YJR053W 1725 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 NCL1YBL024W 2055 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 RTR2YDR066C 591 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YGR045CYGR045C 363 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YAP3YHL009C 993 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MSL1YIR009W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 NCE101YJL205C 162 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 FYV7YLR068W 456 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 LHS1YKL073W 2646 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 TFC8YPL007C 1767 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 IRA1YBR140C 9279 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF2P53277 MEC1YBR136W 7107 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 NOP10YHR072W-A 177 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 NUP82YJL061W 2142 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YJR079WYJR079W 330 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF2P53277 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms