Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP98P52948 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP98P52948 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP98P52948 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP98P52948 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms