Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR1P51861 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR1P51861 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR1P51861 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR1P51861 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR1P51861 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR1P51861 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR1P51861 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR1P51861 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR1P51861 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR1P51861 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms