Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAMP50895 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAMP50895 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms