Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms