Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms