Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC34P49427 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms