Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPHP49418 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPHP49418 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPHP49418 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
AMPHP49418 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPHP49418 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPHP49418 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPHP49418 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPHP49418 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPHP49418 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms