Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms