Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2IP36954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms