Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms