Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHI3L1P36222 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms