Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNB1P35222 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms