Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA7P31268 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms