Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA5P30532 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA5P30532 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms