Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC27P30260 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC27P30260 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC27P30260 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC27P30260 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms