Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms