Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCAP28676 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCAP28676 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCAP28676 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCAP28676 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCAP28676 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCAP28676 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms