Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms