Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNA2P26232 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms