Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO2P25791 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO2P25791 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO2P25791 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO2P25791 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMO2P25791 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMO2P25791 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO2P25791 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO2P25791 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO2P25791 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMO2P25791 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms