Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRGP23470 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRGP23470 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
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