Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRBP23467 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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