Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGS1P23219 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGS1P23219 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms