Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGFR3P22607 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms