Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT1P21579 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT1P21579 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT1P21579 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT1P21579 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms