Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK11BP21127 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms