Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms