Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms