Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD58P19256 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD58P19256 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD58P19256 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD58P19256 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD58P19256 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD58P19256 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD58P19256 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD58P19256 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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