Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF3P18847 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATF3P18847 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF3P18847 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF3P18847 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF3P18847 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF3P18847 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF3P18847 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF3P18847 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF3P18847 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF3P18847 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF3P18847 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms