Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB9P17482 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms