Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA2P17301 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms