Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZSCAN20P17040 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSCAN20P17040 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms