Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPCAMP16422 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPCAMP16422 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms