Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTLA4P16410 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTLA4P16410 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms