Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD8P13378 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms