Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMC1P11047 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms