Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARBP10826 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARBP10826 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARBP10826 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARBP10826 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARBP10826 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARBP10826 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms