Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms