Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LYNX1P0DP58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYNX1P0DP58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms