Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC192P0DO97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms