Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms