Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL1P09341 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL1P09341 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms