Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DRAP01903 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DRAP01903 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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