Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms